Научная методика биологического обследования плодовых насаждений разработана профессором Сельскохозяйственной академии им. К. А. Тимирязева П. Г. Шиттом. Эта методика широко используется при изучении пригодности земель, отводимых под сады, при оценке сортов в производственных насаждениях, при разработке комплексов агромероприятий для получения высоких устойчивых урожаев.
Биологическое обследование сада начинают с выбора типовой скелетной ветви с двух противоположных экспозиций — южной и северной, чтобы установить разницу в реакции сортов на освещенность, выяснить долговечность плодовых образований и особенности плодоношения в зависимости от освещенности. Выбранная ветвь должна располагаться в хорошо освещенном и проветриваемом пространстве, не переплетаться с другими и иметь типичные по силе развития вегетативные приросты и плодовые образования. Особое внимание при выборе ветвей уделяют ярусности, углам отхождения ветви от оси, облиствеиности, силе развития годичного побега и качеству плодовых образований. На ветви не должно быть признаков подмерзания и болезней коры и древесины.
На каждой скелетной ветви можно без труда обнаружить наиболее разветвленную верхнюю зону — ее концевую часть; оголенную зону — ее основание и переходную зону — среднюю часть.

Зоны ветвления многолетней ветви яблони
I — зона максимального ветвления; II — переходная зона; III — зона оголения
Верхняя часть богата приростами и молодыми образованиями плодового типа. В большинстве случаев это сильные кольчатки, копьеца, прутики. В переходной зоне находятся обрастающие ветки и веточки более старшего возраста, от сильных до слабых. В нижней зоне (оголения) обрастающих веток почти нет или встречаются единичные непродуктивные отмирающие ветки и веточки.
Достаточное представление о биологических свойствах и хозяйственно ценных признаках сорта можно составить по верхней части скелетной ветви, где размещаются сильные приросты и хорошо развитые плодовые образования. Анализируя верхнюю зону типовой скелетной ветви, можно составить представление о жизнедеятельности всего дерева и его хозяйственно ценных свойствах. По протяженности зоны оголения и ее возрасту судят об отмирании обрастающих веток и веточек, о прорастании спящих почек, о способностях восстанавливать утраченные органы и т. д. Анализируя переходную зону, устанавливают процессы самоомолаживания плодовых образований, качество омоложенных и вновь возникших обрастающих веток и веточек.
Порядок учета рекомендуется следующий.
На избранной ветви устанавливают главное направление роста. Как правило, концевая часть ветви выдвинута вперед и тогда хорошо видно направление роста всей ветви. Но иногда в верхней части ветви, наряду с хорошо отличимым побегом продолжения, находятся один-два сильных прироста, не уступающих по развитию побегу продолжения. В этом случае избирают главное направление роста по одному из побегов. Затем устанавливают по годичным кольцам возраст избранной ветви. Подсчет возраста проводят сверху вниз. Затем снизу вверх устанавливают границы трех зон: зоны оголения, переходной зоны и зоны активного ветвления. В каждой зоне измеряют длину отрезка и записывают его возраст.
Детальный учет вегетативных и плодовых образований проводят в зоне максимального ветвления и облиственности (верхняя зона). Вначале измеряют длину побега продолжения, затем подсчитывают число боковых однолетних приростов и измеряют их общую длину. После этого приступают к анализу плодовых образований, расположенных в этой зоне, — кольчаток, плодушек, копьец и прутиков. Их считают независимо от порядка ветвления.
В переходной зоне у большинства сортов кольчатки, плодушки, копьеца и прутики в первоначальном виде уже не встречаются. Некоторые из них отмерли, другие (более сильные) проросли после плодоношения и изменили свой внешний вид. В зависимости от местоположения на скелетной ветви, условий питания и выполняемых функций кольчатка может видоизмениться в плодушку или прорасти и дать копьецо или прутик и т. д.
Каждое из этих образований может расти в высоту, ветвиться и по-разному изменяться. Если копьецо или прутик несколько лет подряд не плодоносит, не ветвится и закладывает только ростовые почки, то образуется простая веточка ростового типа. Если копьецо или прутик ветвится, но не плодоносит и закладывает ростовые почки, то образуется веточка ростового типа. Если копьецо или прутик плодоносит и снова закладывает плодовые почки, то образуется веточка плодового типа. Если в процессе разрастания кольчатки, копьеца или прутика образуются как плодовые, так и вегетативные органы, такую веточку называют смешанной. В зависимости от облиственности, продуктивности, наличия жизнедеятельных пунктов, качества почек и величины веточек их делят на сильные, средние и слабые.
В переходной зоне ограничиваются учетом разросшихся обрастающих веток и веточек. При углубленных исследованиях сортовых свойств проводят учет кольчаток, копьец и прутиков на каждой ветке в отдельности.
У некоторых сортов, помимо мелких обрастающих веточек, в переходной зоне встречаются и более крупные ветки полускелетного типа. Их учитывают по-разному, при детальном изучении биологических свойств сорта на них учитывают годичные приросты вегетативного типа и все виды плодовых образований. При изучении только основных особенностей роста и плодоношения проводят подсчет полускелетных веток и распределяют их по качеству на сильные, средние, слабые.